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类芽胞杆菌碱性果胶裂解酶的纯化与酶学性质表征

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第11卷第6期 2013年11月 生物加工过程 Vo1.11 No.6 NOV.2013 Chinese Journal of Bioprocess Engineering doi:10.3969/j.issn.1672—3678.2013.06.009 类芽胞杆菌碱性果胶裂解酶的纯化与酶学性质表征 熊 斌,应向贤,陈丽娜,谢丽萍,魏 春,汪 钊 (浙江工业大学生物与环境工程学院,杭州310014) 摘要:从类芽胞杆菌Paenibacillus sp.WZO08的发酵上清液中纯化得到一个高活力碱性果胶裂解酶,经SDS—PAGE 电泳估算其亚基相对分子质量为4.5×10 。通过对该酶进行酶学性质研究发现:该酶能催化裂解果胶酸、低酯果 胶和高酯果胶;酶催化反应最适温度范围为55~60℃,最适pH为9.6,在最适条件下以低酯果胶为底物酶的比酶 活达3 021.6 U/mg;Ca“能增强该酶的活力,而Mn“,Ba“和EDTA强烈抑制该酶活力;'3没有ca“存在时,高度 -酯化的果胶是该酶的最适底物,在4 mmol/L Ca“存在时,该酶以果胶酸为底物比酶活最高(25 467 U/mg)。该酶N 端序列比对分析发现与类芽胞杆菌Paenibacillus amylolyticus strain 27e64果胶裂解酶高度同源。 关键词:酶争陛质;酯化果胶;碱性果胶酶;纯化 中图分类号:Q814 文献标志码:A 文章编号:1672—3678(2013)06—0042—05 Puriication and characterizatifOn of alkaline pectate lyase from Faenibacillus sp.WZ008 XIONG Bin,YING Xiangxian,CHEN Lina,XIE Liping,WEI Chun,WANG Zhao (College of Biological and Environmental Engineering,Zhejiang University of Technology,Hangzhou 3 10014,China) Abstract:An extracellular pectate lyase was puriifed from the culture supematant of Paenibacillus sD. WZ008 grown in the pectin-containing medium.The subunit molecular weight of the puriied enzyme was fdetermined to be around 4.5×10 by SDS.PAGE analysis.It showed activity on both polygalacturonic acid and methylated pectins.The optimum activity of the puriifed enzyme was demonstrated in a temperature range of 55℃to 60℃and at pH 9.6.The speciifc activity of pectate lyase was up to 3 021.6 U/mg using 20%methylated pectin as substrate under the optimized conditions.The Ca“ ,enhanced the enzyme activity but Mn“Baz ,and EDTA strongly inhibited it.Highly methylated pectin was the optimum substrate without Ca addition while the enzyme exhibited the maximal activity f 25 467 U/mg)on polygalacturonic acid in the presence of 4 mmol/L Ca .The amino.terminal sequence of the enzyme was highly identical to that of a pectate lyase from Paenibacillus amylolyticus strain 27c64. Key words:characterization;methylated pectin;alkaline pectate lyase;purification 果胶裂解酶(PEL,EC 4.2.2.2)能通过 一消除 的环境中催化效率较高,是对棉织物精炼效果最好 断裂聚半乳糖醛酸(PGA)的 一1,4糖苷键得到4, 5位不饱和产物 。碱性果胶酶通常在pH 8~10 的酶 ,可以从未加工棉中去除非纤维素物质从而 提高棉的吸收能力和洁白度 。与化学加工过程 收稿日期:2013—01—30 基金项目:浙江省自然科学基金(LY12B06010);教育部留学回国人员科研启动基金(第40批) 作者简介:熊斌(1988一),男,湖北荆州人,硕士研究生,研究方向:生物催化与转化;汪钊(联系人),教授。E—mail:hzwangzhao@163.corn 第6期 熊斌等:类芽胞杆菌碱性果胶裂解酶的纯化与酶学性质表征 43 相比,纺织原料的酶法生物精炼对环境更友好。除 此之外,碱性果胶酶还可用于麻类生物脱胶、生物 制浆、果胶低聚糖制备等方面,同时它也是一种重 要的饲料用酶 。最新的研究表明碱性果胶酶在 植物抗病中具有良好的诱导效果_5 。 碱性果胶酶的嗜碱性是其基本特征,细菌碱性 果胶裂解酶最适作用pH一般在8~10,有报道果胶 裂解酶最适pH可高达11.5 71。由于许多细菌在偏 碱性的环境生长良好,因而细菌是碱性果胶裂解酶 的主要微生物来源。许多微生物碱性果胶裂解酶 的酶学性质已被表征,其微生物来源包括Bacillus、 Paenibacillus、Pseudomonas、Erwinia和Xanthomonas 等_4 J。尽管碱性果胶酶的相关研究已有较多报道, 但发现并研究新型高活力的碱性果胶裂解酶对其 工业应用仍具有重要的意义。 碱性果胶裂解酶产生菌Paenibacillus sp. WZ008是从腐烂的水果表皮筛选到的,笔者所在课 题组吴茜等 前期研究已表明其在生物精炼上具 有应用潜力。在此基础上,笔者对类芽胞杆菌 Paenibacillsu sp.WZ008碱性果胶裂解酶进行分离 纯化,并对其酶学性质进行了详细表征,以期为其 工业应用提供基础数据。 1材料与方法 1.1材料 1.1.1 菌种 类芽胞杆菌Paenibacillus sp.WZO08是浙江工 业大学生物细胞培养实验室筛选并保存的菌种。 1.1.2试剂与药品 层析填料Ceramic Hydroxyapatite TYPE I,Bio- Rad公司;层析填料Superdex 200 prep grad,GE Heahhcare公司;果胶酸、低酯及高酯果胶均由衢州 果胶公司提供。其他试剂和药品均为国产分析纯。 1.1.3仪器 蛋白质电泳仪、低压层析仪(BioLogic LP,Bio- Rad公司),AKTA蛋白层析系统、紫外可见分光光 度计(Amersham公司)。 1.2方法 1.2.1类芽胞杆菌Paenibacillsu sp.WZO08的培养 用于类芽胞杆菌Paenibacillus sp.WZO08生长 的液体培养基组成:1 L的培养基中蛋白胨10 g;酵 母膏10 g;酯化果胶6 g。固体培养基在上述液体培 养基中加入2O g/L的琼脂。类芽胞杆菌 Paenibacillus sp.WZ008在该液体培养基中于30 qC、 200 r/min下培养46 h。所得的发酵液于6 000 g下 离心15 min,收集上清液用作后续实验。 1.2.2类芽胞杆菌Paenibacillsu sp.WZO08果胶裂 解酶的纯化 将离心得到的500 mL上清液先用50%的饱 和(NH ):SO 沉淀去除杂质,然后用80%的饱和 (NH ) SO 沉淀果胶酶。将用80%的饱和 (NH )2s04得到的沉淀重新悬浮于含有5 mmol/L K PO 的50 mmol/L Tris-HC1缓冲液(pH 8.0)中。 悬浮好的酶液以0.5 mL/min的流速上样到预先 平衡好的羟基磷灰石柱中(1.5 cm x 20 em),上样 量为10 mL,用含有5~250 mmoL/L K PO4的Tris— HC1(50 mmoL/L,pH 8.0)线性梯度洗脱果胶酶,洗 脱流速为1 mL/min。将含有果胶酶活力的洗脱组 分合并到一起,并通过PM一30的超滤膜浓缩。浓 缩好的试样(0.5 mL)用于后续Superdex 200凝胶 过滤色谱(1.0 am x 30 cm),该柱的平衡和洗脱都 以50 mmol/L Tris—HC1(pH 8.0)为缓冲液,流速为 0.5 mL/min。在分离过程中,果胶裂解酶试样通 过SDS.PAGE电泳来验证其纯度。纯化后的果胶 裂解酶N一端序列测定由上海基康生物技术公司 完成。 1.2.3果胶裂解酶活力测定 果胶裂解酶活力的测定是通过测定其在235 nm处的吸光度增值来实现的_9 J。反应的具体流程 如下:先将400 L的底物溶液(50 mmol/L pH 9.6 的Gly.NaOH缓冲液中含有0.33%的聚半乳糖醛酸 或果胶)于55℃下预热,然后加入200 L的酶液, 于55℃下保温10 min。取出200 I.tL的反应液加入 1.8 mL HC1(0.01 mol/L)终止反应,最后测定波长 235 nm的吸光值。一个酶活力单位定义为每分钟 产生1 lxmol不饱和半乳糖醛酸所需的酶量,计算所 使用的摩尔消光系数为4 600 cm /mol【10]。文中所 有相对活力的100%均指以20%酯化果胶为底物测 得的比酶活。 1.2.4果胶裂解酶的性质表征 用于果胶裂解酶最适pH测定的缓冲液为50 mmol/L Tris—HC1(pH 7.9~8.8)和Gly—NaOH(pH 8.8~1 1.1)。酶的pH稳定性测定是将酶置于 pH 9.3或9.6的缓冲液中于4℃下保留一段时 间,然后测定残留活力。温度对酶活力影响是在 pH 9.6的Gly.NaOH中进行,温度变化范围40~ 生物加工过程 第11卷 70℃。0.33 mmoL/L不同金属离子加入到反应 体系中,然后检测活力,从而确定不同金属离子 2结果与讨论 2.1 类芽胞杆菌PaenibaciUus sp.WZ008果胶裂 解酶的分离纯化 对酶的影响。为了测定酶的热稳定性,先将酶液 分别于50、55和60℃孵育,然后按照常规的活 力测定方法测定其残留活力。酶动力学参数测 定反应体系如下,底物质量浓度范围为0.2~8 mg/mL,温度为55℃,缓冲液为pH 9.6的50 通过(NH ):SO 沉淀、羟基磷灰石和凝胶过滤 8 6 4 3 2 l 色谱等步骤对类芽胞杆菌Paenibacillus sp.WZ008 ×× × × × O 0 O D D 2 × 果胶酶进行分离纯化,结果见表1。由表1可知: mmol/L Gly—NaOH,利用双倒数作图法计算 和 值。 1.2.5蛋白质浓度和果胶裂解酶亚基相对分子质 量的测定 总纯化倍数为53.5倍,酶活力总收率为27%,纯 酶的比酶活达到3 021.6 U/mg,高于已报道的果 胶裂解酶活力 , ,属于高活力果胶裂解酶。 SDS.PAGE电泳鉴定结果见图1。由图1可知,纯 蛋白质浓度的测定采用Bradford检测法 ,果 胶酶亚基相对分子质量通过SDS.PAGE电泳测定。 化后的酶只有单一条带,估算其亚基相对分子质 量为4.5×10 。 表1 类芽胞杆菌Paenibacillus sp.WZ008果胶裂解酶的分离纯化 Table 1 Purification of pectate lyase from PaenibaciUus sp.WZ008 注:a是指以20%酯化果胶为底物进行果胶裂解酶活力测定的结果。 2 的催化活力的影响,结果见图2。由图2可知:在 pH 7.8~11.1范围内该酶都有活力,当pH为9.6 时酶活力最高,因此该果胶酶属于碱性果胶酶家 族。对其pH稳定性的分析表明,当酶在4 cI=下于 pH 9.3和9.6缓冲液中孵育4 h后,酶的残留活力 分别为初始活力的96.5%和74.7%,表明该酶在碱 性条件下具有良好的稳定性。 1一蛋白质质量标准;2一纯化后的果胶酶 图1 Paenibacillus sp.WZ008果胶裂解 酶的SDS-PAGE分析结果 Fig.1 SDS-PAGE analysis of purified pectate 蜒 莨 lyase from Paenibacillus sp.WZ008 2.2类芽胞杆菌Paenibacillus sp.WZ008果胶裂 解酶的酶学性质 2.2.1 pH对酶活力影响 考察pH对Paenibacillus sp.WZ008果胶裂解酶 图2 pH对PaenibaciUus sp.WZ008 果胶裂解酶的催化活力影响 Fig.2 Effects of pH on activity ofpuriifed pectate lyase from PaenibaciUus sp.WZ008 第6期 熊斌等:类芽胞杆菌碱性果胶裂解酶的纯化与酶学性质表征 45 2.2.2温度对酶活力影响 由于细菌碱性果胶裂解酶的最适作用温度一般 为40—70℃ ,所以笔者考察不同温度(40~ 70 oC)下,温度对Paenibacillus sp.WZO08果胶裂解酶 活力的影响,结果见图3。由图3可知:酶的最适温度 范围为55~6O c【=。纯酶在低于50℃的条件下活力 相对比较稳定,同时,该酶在50℃下活力半衰期为15 h。当温度增加到55 时,酶的半衰期降至3 h,而温 度高于60 qC时,酶则会很快失活(图4)。 !}g 莨 图3温度对Paenibacillus sp.WZ008 果胶裂解酶活力的影响 Fig.3 Effects of temperature on activity of pectate lyase from Paenibacillus sp.WZ0O8 媲 霞 O 5 1O 15 时间,h 图4 PaenibaciUus sp.WZ008果胶裂解酶的热稳定性 Fig.4 Thermostability of pectate lyase from Paenibacillus sp.WZ008 2.2.3金属离子和EDTA对酶活力影响 考察不同金属离子对酶活力影响,结果见图5。 由图5可知:0.33 mmoL/L的Ca“极大增强了酶的 活力,与不加Ca¨对照相比,活力提高了1.7倍,同 时,其他二价金属离子,如Mg“、Cu“、Co“、Ni“和 Zn 对酶活力影响不明显,酶活力范围为不加Ca“ 对照的95%~109%(图5)。Ba“能强烈地抑制该 果胶裂解酶的活力,其酶活力仅为不加ca¨对照的 7%,这一性质与报道的来自芽胞杆菌Bacillus sp. BP一23果胶裂解酶相似 。另外,Mn“和EDTA 也对酶有明显的抑制作用,其酶活力分别为不加 Ca 对照的66%和53%。在没有外加Ca 的情况 下该酶仍有较高活力,这可能是由于底物中微量的 残留Ca 引起的。当PGA、20%酯化果胶和70%酯 化果胶分别用作底物时,最适ca 添加浓度分别为 2、4和4 mmo ̄L(图6)。 120 60 O 金属离子和EDTA 图5 金属离子和EDTA对酶活力的影响 Fig.5 Effects of metal ions on activity of pectate lyase from Paenibacillus sp.WZ008 !{g 靛 O 2 4 6 8 lO c(Ca ̄ )/(mmol‘L- 、 图6 PaenibacUlus sp.WZO08果胶裂解酶的底物特异。眭 Fig.6 Substrate speciifcity of purified pectate lyre from Paenibacillus sp.WZ008 2.2.4底物特异性 分别考察该果胶裂解酶对PGA、20%酯化果胶 和70%酯化果胶的特异性,催化反应中Ca¨添加量 范围是0~10 mg/mL。当不向反应中外加Ca“时, 该果胶酶对70%酯化果胶活力最高(25 467 U/mg),分别是PGA和20%酯化果胶活力的3.09 和1.88倍。当反应混合体系中加入4 mmo ̄L CaC1,时,酶对PGA活力最高,分别是20%和70%酯 化果胶活力的1.25和1.46倍(图6)。 2.2.5动力学参数 分别以PGA,20%酯化果胶和70%酯化果胶为 底物,在0.2—8 mg/mL底物质量浓度范围内测定 酶的比酶活,结果见图7。由图7可知:在不同底物 下,该果胶裂解酶的酶促反应动力学均符合 生物加工过程 第11卷 Michaelis.Menten动力学,因而经Lineweaver.Burk双 倒数作图法计算酶动力学参数 和 值。当所 用底物为20%酯化果胶时,酶的K 值为3.77 mg/mL,酶促反应的 为8 560 U/mg,而底物变为 70%酯化果胶时,酶的 值增加到4.17 mg/mL,酶 促反应 。 则变为10 800 U/mg。该果胶裂解酶对 PGA的K 值为3.39 mg/mL,同时酶促反应 为 9 400 U/mg。 O 暑 ● 0 娌 鞋 丑 p慷物)/(mg・mL ) 图7酶在不同底物浓度下的比酶活 Fig.7 Effects of substrate concentrations on activity of pectate lyase from Paenibacillus sp.WZ008 2.2.6 N一端序列结果 经测定得到该果胶裂解酶的N一端序列为 AGNADYNLTGFSQGN,通过Blast序列比对发现,该 序列与来自类芽胞杆菌Paenibacillus amylolyticus strain 27c64果胶裂解酶PelB的同源序列具有很高 的相似度(14/15的相似度)。与Paenibacillus sp. WZ008果胶裂解酶类似,该类芽胞杆菌果胶裂解酶 也表现出对酯化果胶和聚半乳糖醛酸均有活力_】 , 但其活力却远远低于本文所报道的果胶裂解酶。 另外,作为胞外酶,Paenibacillus sp.WZ008果胶裂解 酶的N一端序列以丙氨酸而不是以甲硫氨酸为起始 氨基酸,这也意味着该酶的信号肽在翻译后已被 切除。 3 结 论 通过(NH ) SO 沉淀、羟基磷灰石柱层析及凝胶 过滤柱层析从类芽胞杆菌发酵液中纯化得到一个果 胶裂解酶。该酶底物谱广,以果胶酸、低酯果胶或高 酯果胶为裂解底物时该酶均表现出高活力。该酶最 适作用pH为9.6,属于碱性果胶裂解酶,在碱性条件 下具有良好的稳定性。最适作用温度范围为55~ 60℃,在5O cIC下热稳定性较好。Ca2 对酶的活力具 有显著促进作用。该酶N一端序列比对分析表明与 一个解淀粉类芽胞杆菌果胶酶高度同源,而其活力远 高于解淀粉类芽胞杆菌果胶酶,以高酯果胶为底物时 酶动力参数 可高达10 800 U/mg。 参考文献: [1]Payasi A,Sanwal R,Sanwal G G.Microbila pectate lyases: characterization and enzymological properties[J].World J Microbiol Biotechnol,2009,25(1):1—14 [2]Kalantzi S,Mamma D,Christakopoulos P,et a1.Effect of pectate lyase bioscouring on physical,chemical and low-stress mechanical properties of cotton fabrics[J].Bioresour Technol,2008,99 (17):8185—8192. [3]Tzanov T,Calafell M,Guebitz G M,et a1.Bin-preparation of cotton fabrics[J].Enzyme Microb Technol,2001,29(6): 357-362. 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