专利名称:一种基于残基距离和接触信息的蛋白质结构预测方
法
专利类型:发明专利
发明人:张贵军,彭春祥,刘俊,周晓根,王柳静,胡俊申请号:CN201810631706.6申请日:20180619公开号:CN109033744A公开日:20181218
摘要:一种基于残基距离和接触信息的蛋白质结构预测方法,在Rosetta的基本框架下,引入表示空间中各个位置上残基的相互距离的距离谱和残基接触信息来提高能量函数的精度。首先初始化构象,用Rosetta第一阶段的片段组装技术生成初始种群,并在初始种群中分别对每个构象用Rosetta第二阶段的片段组装来生成新构象;然后根据设计的残基距离谱和接触信息能量函数来指导构象选择,从而更新种群;最后,按上述步骤分别进行Rosetta第三阶段和第四阶段,从而得到最终预测结果。通过残基距离和接触信息为辅来指导构象选择,从而缓解能量函数不精确导致的预测误差问题。本发明预测精度较高。
申请人:浙江工业大学
地址:310014 浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号
国籍:CN
代理机构:杭州斯可睿专利事务所有限公司
代理人:王利强
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