血液、细胞、组织基因组DNA提取试剂盒步骤
使用前请先在缓冲液GD和漂洗液PW中加入无水乙醇,加入体积请参照瓶上的标签。
1. 处理材料
a. 如提取材料为血液,可直接使用200ul新鲜、冷冻或加入各种抗凝剂的血液,不足200ul可加入缓冲液GA补足;
注意:如需处理更大体积血液,如300ul-1ml,可按以下步骤操作:在样品中加入3倍体积红细胞裂解液(例如300ul血液加入900ul红细胞裂解液),颠倒混匀,室温放置5min,期间再颠倒混匀几次。10000rpm(~11500×g)离心1min(若离心机最高转数不允许,可3000rpm(~3400×g)离心5min),吸去上清,留下白细胞沉淀,加200ul缓冲液GA,振荡至彻底混匀。
b. 如果处理血样为禽类、鸟类、两栖类或更低级生物的抗凝血液,其红细胞为有核红细胞,因此处理量5-20ul,可加入缓冲液GA补足200ul后进行下面的裂解步骤;
c. 贴壁培养的细胞应先处理为细胞悬液,然后10000rpm(~11200×g)离心1min,倒尽上清,加200ul缓冲液GA,振荡至彻底悬浮;
d.动物组织(脾组织用量应少于10mg)应先打碎处理为细胞悬液,然后10000rpm(~11200×g)离心1min,倒尽上清,加200ul缓冲液GA,振荡至彻底悬浮;
注意:如果需要去除RNA,可加入4ul RNase A(100mg/ml)溶液(客户自备,目录号:RT405-12),振荡15s,室温放置5min。
2. 加入20ul Proteinase K,混匀。
a. 提取血液基因组时,只需加入Proteinase K混匀,即可继续进行下一步。
b. 提取细胞基因组时,只需加入Proteinase K混匀,即可继续进行下一步。
d. 提取组织基因组时,加入Proteinase K混匀后,在56℃放置,直至组织溶解,简短离心以去除管盖内壁的水珠,再进行下一步骤。
注意:不同组织裂解时间不同,通常需1-3h即可完成(鼠尾需要消化过夜)。不会影响后续操作,每小时颠倒混合样品2-3次,用水浴振荡器也可。
3. 加入200ul缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃放置10min,溶液应变清亮,简短离心以去除管盖内壁的水珠。
注意:加入缓冲液GB时可能会产生白色沉淀,一般70℃放置时会消失,不会影响后续实验。如溶液未变清亮,说明细胞裂解不彻底,肯能导致提取DNA 量少和提取出的DNA不纯。当血液体积≤200ul且没有采用红细胞裂解处理,
或是样本储存条件不佳,水浴后颜色可能为深褐色,注意溶液中没有团块等沉淀。
4. 加200ul无水乙醇,充分振荡混匀15s,此时可能会出现絮状沉淀,简短离心以去除管盖内壁的水珠。
5. 将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12000rpm(~13400×g)离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
6. 向吸附柱CB3中加入500ul缓冲液GD(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12000rpm(~13400×g)离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
7. 向吸附柱CB3中加入600ul漂洗液PW(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12000rpm(~13400×g)离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
8. 重复操作步骤7。
9. 将吸附柱CB3放回收集管中,12000rpm(~13400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附柱CB3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。
10. 将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50-200ul洗脱缓冲液TE,室温放置2-5min,12000rpm(~13400×g)离心2min,将溶液收集到离心管中。
注意:洗脱缓冲液体积不应少于50ul,体积过小影响回收率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用ddH2O做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率;且DNA产物应保存在-20℃,以防DNA 降解。为增加基因组DNA的得率,可将离心得到的溶液再加入吸附柱CB3中,室温放置2min,12000rpm(~13400×g)离心2min。
注意事项:
1. 第一次使用前应按照试剂瓶标签的说明先在缓冲液GD和漂洗液PW中加入无水乙醇。
2. 样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量也下降。
3. 若缓冲液GA或GB中有沉淀,可在37℃水浴中重新溶解,摇匀后使用。
4. 所有离心步骤均为使用台式离心机,室温下离心。
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