猪瘟巢式RT—PCR监测方法的建立
2022-04-12
来源:乌哈旅游
验研究 猪瘟巢式RT PCR 监测方法的建立 杨若松 ,寇晓晶 ,李敬 ,张俊 ,贺忠海 (1.河北省张家口市动物疫病预防控制中心政府,张家口075000; 2.甘肃省动物疫病预防控制中心。兰州730000) DOl:10.3969/J.ISSN.1671-6027.2013.12.012 猪瘟是一种急性、热性、高度接触性传染病,由于本病死 亡率高,对养猪业的危害极大,是现今严重危害养猪业的主 要传染病之一。本研究根据GenBank收录的CSFV猪瘟野毒 株全基因序列JL1(EU497410)为参照,建立猪瘟病毒PCR 监测方法,该方法具有良好的特异性、敏感性和可重复性。 1样品和试剂 阳性结果为获得了546 lit的特异性目的条带。其结果如图 所示: 图PCR检测猪瘟病毒结果 本实验的样品来自河北省疑似患有猪瘟的猪场,主要试 剂包括TRIz01.I.S Regent购自Invitrogen公司,pGEM—T Easy 购自Promega公司,AMV反转录酶、Rnase—Inhibitor、rTaq DNA聚合酶、dNTPsMix、AMV Reverse Transcriptase、DNA Marker DL 2 000等均购自宝生物(大连)工程有限公司。 2监测引物的设计 2000 1000 760 600 260 1O0 本研究在猪瘟病毒全基因3440~4350位相对保守的核 苷酸之间,设计PCR引物,扩增的目的片段为546nt。 3猪瘟病毒巢式RT—PCR监测方法的建立 12345 M 6789101 1 M.Marker DL2000;1-9为CSFV细胞毒PCR扩增结果; 10为阳性对照;11为阴性对照。 3.1猪瘟病毒KNA的提取明书。 参照TRIzo1.LS Regent试剂说 猪瘟病毒反转录体系为 4猪瘟病毒巢式RT—PCR监测方法的特异性、敏感性、重 复性试验 3.2猪瘟病毒反转录体系的建立20 L:RNA模板3 L、弓I物PR1 1 L、dNTP 4 L、 Rnase—Inhibitor 0.5 L、AMV0.5 L、5 X AMV Buffer 4 L, 通过进一步特异性、敏感性、重复性试验发现,本实验建 立的猪瘟巢式RT-PCR检测方法具有良好的特异性;同时, 可以从拷贝数为102/I ̄L的猪瘟病料中检测到猪瘟病毒,具有 很高的灵敏性;本检测方法具有很高的复核率,重复性很好。 由于本研究建立的猪瘟病毒巢式RT—PCR方法的引物序列 均在具有猪瘟病毒序列的保守区,具有更好的应用前景。 补DEPC水至20 L。42%反转录1h,得到相应的cDNA模 板。 3.3猪症病毒巢式PCK方法的建立步对猪瘟病毒DNA进行扩增: 本实验方法分为2 猪瘟病毒1扩PCR体系为25 L:反转录产物3 L、 10XPCR Buffer 2.5 L、dNTPs 2I-LL、一扩上下游引物PR1 和PF1各0.5 L、rTaq O.25 L、补水至25 L。反应程序为: 94%变性5min;94oC 30s,55℃30s,72%1mJn,共32个循 环;最后72%延伸10min。 猪瘟病毒2扩PCR体系为25 L:3 L 1扩PCR产 物、10×PCR Buffer 2.5 L、dNTPs 2 L、二扩上下游引物 PR2和PF2各0.5 L、rTaq 0.25 L、补水至25 L。反应程 序为:94℃变性5min;94%30s,55 ̄C 30s,72 ̄C lmin,共32 个循环;最后72℃延伸lOmin。 3.4通过凝胶电泳,在凝胶成像设备上观察PCR扩增产物, 2013年第12期 ●