不可以在担保合同中变更主合同。
担保合同是主合同的从合同，主合同无效，担保合同无效。担保合同具体是指为促使债务人履行其债务，保障债权人的债权得以实现，而在债权人和债务人之间，或在债权人、债务人和第三人之间协商形成的，当债务人不履行或无法履行债务时，以一定方式保证债权人债权得以实现的协议。担保合同是基于主合同的基础上进行的一种补充性协议，主合同确定了债权债务关系、履行义务的内容及方式，如果要变更主合同，必须经过双方协商一致并重新签署主合同。债权人和债务人未经保证人书面同意，协商变更主债权债务合同内容，减轻债务的，保证人仍对变更后的债务承担保证责任；加重债务的，保证人对加重的部分不承担保证责任。债权人和债务人变更主债权债务合同的履行期限，未经保证人书面同意的，保证期间不受影响。
担保合同的主合同变更时应当注意：
1、原合同关系的存在；
2、合同变更须有当事人的变更协议；
3、必须有合同内容的变化，合同变更，必须产生使合同的内容改变的效果，否则不能认为是合同的变更；
4、合同变更必须遵循法定的形式。
综上所述，保证合同是主债权债务合同的从合同。主债权债务合同无效的，保证合同无效，但是法律另有规定的除外。保证合同被确认无效后，债务人、保证人、债权人有过错的，应当根据其过错各自承担相应的民事责任。
【法律依据】：
《中华人民共和国民法典》第三百八十八条
设立担保物权，应当依照本法和其他法律的规定订立担保合同。担保合同包括抵押合同、质押合同和其他具有担保功能的合同。担保合同是主债权债务合同的从合同。主债权债务合同无效的，担保合同无效，但是法律另有规定的除外。
担保合同被确认无效后，债务人、担保人、债权人有过错的，应当根据其过错各自承担相应的民事责任。
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