农村合作社有补贴的，具体如下：
1、国家给予农业企业或合作社贷款补贴、购机补贴、种粮补贴及农资综合补贴等；
2、种粮直补、农资综合补贴、生猪标准化规模养殖场（小区）建设、农业保险补贴、粮食最低收购政策、退耕还林补贴、草原生态保护补助等等；
3、土地流转优惠：全国很多地区对合作社土地流转有补贴，比如浙江新昌县对流转土地种植水稻20亩（蔬菜30亩、其他50亩）以上给予经营业主和流出户一次性奖励每亩150元；
4、税收优惠：一般纳税人从农民专业合作社购进的免税农业产品，可按13%的扣除率计算抵扣增值税进项税额。农民专业合作社销售本社成员生产的农业产品，免征增值税；合作社向本社成员销售的农膜、种子、种苗、化肥、农药、农机，免征增值税等；
5、用电用水优惠：规模化生猪、蔬菜等生产的用水、用电与农业同价；电力部门对粮食烘干机械用电按农业生产用电价格从低执行的政策。
法律依据：《中华人民共和国农民专业合作社法》第四十二条
农民专业合作社可以按照章程规定或者成员大会决议从当年盈余中提取公积金。公积金用于弥补亏损、扩大生产经营或者转为成员出资。
每年提取的公积金按照章程规定量化为每个成员的份额。
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