公司用私人微信发工资不合法，主要原因如下：
1、目前国家对企业的社保和地税是实行联网管理，假如老板用个人微信来转账发工资，就没法在国家系统里留下记录，相当于是逃避了社保缴纳和个人纳税的义务；
2、国家关于劳动法和工资支付的问题，也不允许使用微信支付，那一定是要通过正规的对公账户来向员工支付工资，并且代缴社保和个税等费用。
法律依据:
《中华人民共和国劳动法》
第五十条
工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》
第三十九条
当事人提供的证据经查证属实的，仲裁庭应当将其作为认定事实的根据。劳动者无法提供由用人单位掌握管理的与仲裁请求有关的证据，仲裁庭可以要求用人单位在指定期限内提供。用人单位在指定期限内不提供的，应当承担不利后果。
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