医保个人账户余额不足扣补充医疗保险的办法是：
1、医保卡缴费出现余额不足的情况，需要将剩余部分缴纳现金；
2、由个人账户支付的部分是由个人承担的，不参与报销；
3、只有超过起付线，并且属于医保报销范围内的项目才予以报销的。
由本人或参保单位的社保经办人员持本人的书面申请书、参保信息变更表、社保卡复印件验原件、缴费明细单，向社保征收部门申请社保电脑号合并手续。如果连续三个月未能划款成功，社保机构将停止缴费人的社会保险缴费业务。若参保人需结算所欠保费，应到所在区社保机构个人缴费窗口重新申请划扣。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二条
国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
第二十八条
符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
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