(一)劳动关系双方对是否拖欠农民工工资无异议且工资数额明确时：
(1)单位拖欠农民工工资，并向农民工出具了工资条。此时，农民工可以持欠条向有管辖权的法院起诉或者申请支付令。当法院判决或支付令生效后，农民工可以申请法院强制执行。
(2)农民工认为拖欠工资数额明确的，可以向当地劳动部门申请行政处理。
根据《劳动法》规定，用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，由劳动行政部门责令其支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令其支付赔偿金。
劳动部门依法作出行政处理决定，用工单位在法定期限内既不提起行政诉讼，亦不履行政处理决定的，劳动部门或者农民工可以在法定期限内申请法院强制执行。当劳动关系双方对是否拖欠工资及数额有异议时，由行政处理部门告知农民工申请劳动争议仲裁，行政处理程序终结。
(二)劳动关系双方对是否拖欠农民工工资及拖欠数额有异议时：
此时双方关系为劳动争议，规定“劳动争议发生后，当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解;调解不成，当事人一方要求仲裁的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。”
在劳动争议案件中，劳动争议仲裁程序是前置程序，只有对仲裁裁决不服的才可以向法院提起民事诉讼。劳动争议仲裁裁决做出后，在法定期限内，当事人未提起民事诉讼的，农民工可以申请法院执行劳动争议仲裁裁决。如果引发诉讼，则需待判决生效后，申请法院强制执行。
《中华人民共和国劳动法》第七十九条，劳动争议发生后，当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解；调解不成，当事人一方要求仲裁的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。当事人一方也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
第九十一条，用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的；
（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
（四）解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》
第八十五条用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：
（一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；
（二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
（三）安排加班不支付加班费的；
（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。
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