法律分析：
可以通过以下方式保留证据: 1、采用EMS的方式提交辞职信,邮寄回单可以作为证据使用; 2、直接提出辞职申请,做录音或者录像来证明提交辞职信; 3、按照你公司的要求直接递交辞职信,并且要求接到辞职信的人员签字,写上日期。 员工对于自己辞职的行为本身、辞职的理由负有举证责任。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》
第三条 订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。
第十条 建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。
第三十六条 用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。
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