1、主体不同，审查批捕的主体是人民检察院的侦监科，审查起诉的主体是是由人民检察院公诉科。
2、在案件中所处的阶段不同。审查批捕是侦查机关(一般为公安机关)在立案侦查后，对案件的基本事实有了一定的了解，认为犯罪嫌疑人符合逮捕的条件与有逮捕的必要的，就会把案件移送到检察院侦监科申请逮捕犯罪嫌疑人，经检察院侦监科审查批捕后再移送回侦查机关继续侦查；审查起诉是侦查机关对案件侦查终结后移送到检察院公诉科请公诉科提起公诉，检察院公诉科就对这些案卷进行审查。
3、后果不同。案件经检察院侦监科审查批捕后，后果有两个，就是批准逮捕犯罪嫌疑人或者不予批准逮捕犯罪嫌疑人，案卷会移送回侦查机关继续侦查；案件经过检察院公诉科审查终结后，后果也有两个，起诉或者不起诉，如果是符合起诉条件的案件，经过审查终结后，就会被移送到人民法院提起公诉。
一、什么是审查起诉和审查批捕
1、批准逮捕，是指人民检察院同意公安机关逮捕犯罪嫌疑人的请求。公安机关在侦查中认为需要逮捕犯罪嫌疑人时，应当制作提请批准逮捕书，连同案件材料和证据一并报送人民检察院审査批准。人民检察院审査后，认为主要犯罪事实已经查清，可能判处徒刑以上刑罚，采取取保候审、监视居住等方法尚不足以防止发生社会危险性，而有逮捕必要的，应当批准逮捕。
2、审查起诉是指人民检察院对公安机关移送起诉或免予起诉的案件，审查决定是否起诉的活动。在中国，审查起诉活动是人民检察院职权之一，是刑事诉讼法规定的必经程序。在审查起诉中，人民检察院对侦查阶段查明的犯罪事实和搜集的证据进行全面复查，既是对侦查工作的检查和验收，又是侦查工作的深入和发展，其目的是进一步保证案件的质量。
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