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GST pull down试验方法

2021-04-12 来源:乌哈旅游
12.GST蛋白的表达和纯化

12.1 GST蛋白的表达

(1) 将表达GST融合蛋白的质粒转入BL21大肠杆菌菌株中。

(2) 挑单克隆于3ml LA(LB+Amp)培养基中,37℃摇菌过夜,获得种子液。 (3) 将种子液稀释于50ml2XYTA(YTG+Amp)培养基中,使起始OD600为0.1。 (4) 28℃,220rpm摇菌培养2小时。

(5) 加入50μl 100mM IPTG,16~27℃摇菌培养1~8小时。

(6) 收菌,将菌液倒入大离心管,2管/50ml菌液,4℃ 5krpmx5min离心,弃上清。

(7) 加入10ml PBS/管,重悬细胞,5krpm离心5min,弃上清。 (8) 加入2ml PBS/管,重悬细胞。转移至5ml离心管。 (9) 超声破壁

破壁前,在细胞悬液中加20μl 10mg/ml PMSF,80μl蛋白酶抑制剂(100x)。 破壁参数:Frequency:100~200w 60s, pause 20s run 40s,5cycles破至菌体由浑浊变为澄清。

加100μl 20% TritonX-100,冰上放置30min。

(10) 将裂解液分入1.5ml离心管中,4℃离心12krpm×10min,取上清。 (11) 吸取少量上清,加入蛋白电泳上样缓冲液,在沸水中煮3min。离心(12krpm,1min),取上清作SDS-PAGE电泳,检测表达情况。

12.2 准备50%GST Sepharose 4Bslurry

(1) 将原75%Glutathione Sepharose 4B的slurry弹至混匀。 (2) 取677μl原液/管,3krpm离心5min,弃上清。

(3) 加500μl PBS,颠倒混匀,3krpm离心5min,弃上清。反复5次。 (4) 加500μl PBS,颠倒混匀,配成50%Glutathione Sepharose 4B备用。

12.3 GST融合蛋白的纯化

(1) 在新鲜制备的细胞裂解液上清中加入20μl 50%Glutathione Sepharose 4B,4℃,摇床上摇,反应30min~60min。

(2) 3krpm离心5min,弃上清。该Sepahrose上即结合了GST融合蛋白,(如果仅仅是做纯化效果检测或者蛋白表达量很高,可以只接合一次,如果要结合更多则接着往下做)

(3) 在管中加入离心后的1.5ml新鲜制备的细胞裂解液的上清,4℃,反应

30min~60min。3krpm离心5min,弃上清。重复该步骤多次,就可以使Sepahrose上结合6~10ml 裂解液中的GST融合蛋白。

(4) 在管中加入预冷的200μl PBS(沿壁加入,小心勿剧烈,以免打断珠子与蛋白的联接),轻晃悬浮珠子,将Sepharose洗涤一次, 3krpm离心3min,弃上清。

(5) 反复三次(最后一次以小枪吸净珠子表面水膜,其余几次可以中枪吸,尽量吸净但不吸走珠子),即获得结合有GST融合蛋白的Sepharose。

(6) 如果用于检测,在Sepharose加入15~20μl 1×蛋白电泳上样缓冲液,在沸水浴中煮3min。12krpm离心1min,取上清作SDS-PAGE电泳。 (7) 如果用于pull-down测试,参见pull-down 步骤。

13.pET融合蛋白的表达与纯化

13.1 pET32a融合蛋白的表达

(1) 将表达融合蛋白的质粒转入BL21DE3中。

(2) 挑单克隆于3ml LA培养基中,37℃摇菌过夜,获得种子液。 (3) 将种子液稀释于50ml 2×YTG中,使起始OD600为0.1。 (4) 28℃,220rpm摇菌培养2小时。

(5) 加入50μl 100mM的IPTG,22℃摇菌培养6小时。

(6)收菌,将菌液倒入大离心管,2管/50ml菌液,4℃ 5krpm离心5min,弃上清。

(7) 加入10ml Ni-lysis buffer/管,重悬菌体。5krpm离心5min,弃上清。 (8) 加入2ml Nilysis buffer/50ml菌液,vortex重悬菌体。转移至5ml离心管。 (9) 超声破壁

破壁前,在细胞悬液中加20μl 10mg/ml PMSF,80ul蛋白酶抑制剂。

破壁参数:Frequency:100~200w,60s pause20s run 40s,5cycles破至菌体由浑浊变为澄清。

加100μl 20%TritonX100,冰上放置30min。

(10) 将裂解液分入1.5ml离心管中,4℃ 离心12krpm×10min,取上清。 (11) 吸取少量上清,加入蛋白电泳上样缓冲液,在沸水中煮3min。离心(12krpm,1min),取上清作SDS-PAGE电泳,检测表达情况。

13.2 pET32a融合蛋白的纯化

(1) 在新鲜制备的细胞裂解液上清中加入20μl Ni-NTA珠子 ,4℃,摇床上摇反应30min~60min。

(2) 离心3krpm×5min,弃上清。该珠子上即结合了pET32a融合蛋白,(如果仅仅是做纯化效果检测或者蛋白表达量很高,可以只接合一次,如果要结合更多则接着往下做)

(3) 在管中加入离心后的1.5ml新鲜制备的细胞裂解液的上清,4℃,反应30min~60min。离心3krpm×5min,弃上清。重复该步骤多次,就可以使珠子上结合6~10ml 裂解液中的pET融合蛋白。

(4) 在管中加入预冷的200μl Wash buffer(沿壁加入,小心勿剧烈,以免打断珠子与蛋白的联接),轻晃悬浮珠子,洗涤一次,离心3krpm×3min,弃上清。 (5) 反复三次(最后一次以小枪吸净珠子表面水膜,其余次可以中枪吸,尽量吸净但不吸走珠子),即获得结合有pET融合蛋白的Ni-NTA。

(6) 加入60μl Elution buffer,不必吹打,晃动洗脱蛋白。离心3krpmx5min,吸净上清,pET融合蛋即在上清中。

(7) 如果用于检测,取1~2μl样品,配成15~20μl 1×蛋白电泳上样缓冲液,在沸水浴中煮3min。离心12krpm×1min,取上清作SDS-PAGE电泳。 (8) 如果用于pull down测试,参见pull down 步骤。

14.体外蛋白质结合分析

(1) 将结合有GST融合蛋白的Glutathione Sepharose 4B悬浮在500μlNETN缓冲液中加入20~30μl含有其他蛋白的溶液,例如pET发酵的产物,细胞表达的产物等,同时采用结合有GST空蛋白的Glutathione Sepharose 4B平行操作作为对照。

(2) 在水平摇床上,4晃动4~8小时。

(3) 离心(3.6krpm,2min)。吸去上清,注意不要扰动底层的Sepharose. (4) 加入200μl缓冲液H对Sepharose进行洗涤。注意加入缓冲液H时要贴壁加,不要直接冲击Sepharose,随后轻柔晃动,使Sepharose重悬即可。 (5) 低速离心(3krpm,2min)吸去上清,注意不要扰动底层的Sepharose。 (6) 重复步骤的洗涤2~3次。

(7) 吸干Sepharose上方的水层后,加入20~30μl 1×蛋白电泳上样缓冲液,沸水浴4min,冻存于-20℃。

(8) 做SDS-PAGE和Western检测另一个蛋白。

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