新生儿脓疱疮一经发现应立即隔离和就医。病情轻者可以肌注青霉素或口服抗菌素；病情重者可静脉滴入抗菌素并配合全身支持疗法，局部常外敷1～3%黄连素或0.5%的新霉素软膏，或1%龙胆紫溶液，并在患处四周正常皮肤每隔二至三小时涂50%酒精，以减少自然接触传染的机会。
较重的脓疱疮，大多在头面、胸背有四肢皮肤上，有豌豆大小的疱疹，内含微浑液体，疱疹膨胀到一定程度时可自行溃破，称为天疱疮。 处理时除局部皮肤患处涂药外，还应肌肉注射青霉素，并给予充分的营养和水分。这种情况，一般都要到医院去医治，临床需要1～2周才会痊愈。若未及时处理，或治疗不当，可发展成新生儿脓毒血症，那就危险了。
为了防止脓疱疮的发生，平时宜避免损伤皮肤，勤洗澡、勤换衣裤。出汗多的要随时用干毛巾或手帕吸干，使皮肤保持干燥清洁。
有人主张用0.5%新霉素油膏或杆菌肽油膏（每克内含400～500单位）敷于新生儿脐周围，可以预防皮肤感染。妈妈抱孩子前必须洗手，洗手时可采用含3%六氯酚肥皂。