《本草汇言》载：“脾胃虚弱，中气寒乏者禁食之。”由于芹菜性凉质滑，故脾胃虚寒，腹痛腹泻者不宜多食。
血压低者芹菜有降血压作用，血压偏低者不宜多食。
生育期男性据报道，国外有医生经过实验发现，男性多吃芹菜会抑制雄性激素的生成，影响生育，此种情况在停止食用芹菜后数月又可恢复正常，故生育期男性不宜多食。
过敏体质者芹菜属光敏性强的蔬菜，食之过多，容易导致光敏性物质在体内增加，此时如果照射强光，就会和日光发生反应，引起日光性皮炎等皮肤炎症。芹菜含少量呋喃香豆素，易引起皮炎，若受霉菌感染，则含量快速升高。经常或大量接触者，手臂及指间往往发生疱疹性皮炎。至于癞疥患者，最好勿食。