农村环境保护是关系提高农民生活质量、改善农村面貌、推动社会主义新农村建设的一项重要基础性工作。
当前，随着农业集约化的快速发展和农村生产方式的转变，以及城镇化和工业化对农村生态环境的负面影响增加，加剧了我国农村环境的总体恶化。而农村环保基础设施建设严重滞后，环境监管能力薄弱以及环保资金普遍短缺，使农村的环境保护和治理困难重重。为此，我们建议：
一、建立统筹城乡与区域的环境保护管理机制。加强城市环保基础设施、公共设施向农村地区的辐射和延伸，逐步实现城乡环保一体化。
二、制定各级农村环境保护规划。在国家层面应尽快制定出台《全国农村环境污染防治规划》，明确指导思想、分期目标与重点方向。
三、加强农村环境保护制度性基础工作。尽快制定、颁布《土壤污染防治法》、《畜禽养殖污染防治条例》、《农村环境保护条例》等，依法加强对农村环境的监督管理。
四、建立多元化的生态补偿机制。首先，建立国家生态补偿专项资金，用于跨省行政区域的流域生态补偿;建立省级生态补偿专项资金，用于跨设区市行政区域的流域生态补偿。其次，开征生态补偿税，集中财力支持重点生态区域的生态保护与建设。再次，建立财政转移支付机制，上游地区为保育和改善生态环境限制了地方经济发展，流域下游地区政府应对上游地区进行财政转移支付。
五、强化农村环境污染治理资金保障机制。建立完善以各级政府财政支持为导向、农村集体和农户投入为主体、工商企业及社会团体等其它社会资本共同参与的稳定投入渠道。
六、研究普及农村环保实用技术。结合发展农业循环经济、清洁生产，把畜禽养殖污染治理、秸秆等废弃物综合利用有机结合起来，实现农村生活污水的生态化处理和粪便、垃圾、秸秆等的资源化利用。