实习协议可设违约金，但需合理约定。根据《劳动合同法》，用人单位与实习生可在合同中约定涉及专项培训、商业秘密保密、知识产权保密等方面的条款，并设定一定的违约金。违约金不得超过培训费用或未履行服务期部分的费用。除此之外，用人单位不得要求劳动者承担违约金。
法律分析
实习协议可以有违约金。一般情况来说，用人单位不得以附加违约金为由，加重劳动者的履行义务，但如果在实习生工作过程中涉及专项培训、商业秘密保密、知识产权保密等方面内容的，用人单位及劳动者双方可以在合同中约定相关条款并设定一定的违约金。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》第二十二条
用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。
劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
用人单位与劳动者约定服务期的，不影响按照正常的工资调整机制提高劳动者在服务期期间的劳动报酬。
第二十三条
用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。
对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
第二十五条
除本法第二十二条和第二十三条规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。
结语
根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十二、第二十三和第二十五条的规定，实习协议可以约定违约金。如果实习生在工作过程中涉及专项培训、商业秘密保密、知识产权保密等方面内容，用人单位和劳动者可以在合同中约定相关条款并设定一定的违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，并且用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。除此之外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。
法律依据
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第二章 劳动合同的订立 第二十二条 【服务期】用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。
劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
用人单位与劳动者约定服务期的，不影响按照正常的工资调整机制提高劳动者在服务期期间的劳动报酬。
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第二章 劳动合同的订立 第二十五条 【违约金】除本法第二十二条和第二十三条规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第二章 劳动合同的订立 第二十三条 【保密义务和竞业限制】用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。
对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。