法律分析：新农合报销费用会打到新农合一卡通上。1、普通门诊：参合农民携带本人新农合就诊卡在乡、村两级医疗机构（区卫生局批准的一体化村卫生室和乡镇定点医疗机构）门诊就医时，通过新农合HIS系统就可获得即时补偿。2、慢性病（特殊）门诊：慢性病患者必须到新农合定点医院就诊，原则上先由病人自付全部医药费用，然后凭电脑打印的收费发票、慢性病就诊证和病历本、新农合就诊卡、身份证或户口本复印件，每半年到当地卫生院或乡镇合管所申请补偿一次，经区合管中心审核后将补偿款拨付到患者涉农帐户上。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。