小诊所医疗事故纠纷处理方式如下：,（一）双方自愿协商；,（二）申请人民调解；,（三）申请行政调解；,（四）向人民法院提起诉讼；,（五）法律、法规规定的其他途径。法律依据：《医疗事故处理条例》第四十六条 发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决;不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。《医疗纠纷预防和处理条例》第二十二条 发生医疗纠纷，医患双方可以通过下列途径解决：
（一）双方自愿协商；
（二）申请人民调解；
（三）申请行政调解；
（四）向人民法院提起诉讼；
（五）法律、法规规定的其他途径。