劫持汽车罪和破坏交通工具罪的区别是劫持船只、汽车罪的行为人通常采取暴力、胁迫或者其他方法劫持船只、汽车,破坏交通工具罪的行为人通常是采取盗窃、爆炸等手段破坏。前者的犯罪对象仅限于船只、汽车,后者的犯罪对象则不限于船只、汽车,还包括火车、航空器等。【法律依据】《中华人民共和国刑法》第一百二十二条以暴力、胁迫或者其他方法劫持船只、汽车的,处五年以上十年以下有期徒刑;造成严重后果的,处十年以上有期徒刑或者无期徒刑。