"跨县住院新农合报销流程如下：,1.患者本人或者家属带患者身份证（或户口本）、两张一寸彩色照片、新农合医疗证到参合地经办机构转诊备案手续，也可以致电办理；,2.携带患者身份证、新农合医疗证和转诊备案手续到转诊医院就医，办理新农合住院手续，只有要找跨省定点医疗机构就医；,3.患者住院接受治疗；,4.出院后，凭患者本人身份证（或户口本）、新农合医疗证、病历复印件、住院结算单（有的是发票形式的）、住院费用清单、转诊备案手续到参合地经办机构报销。",法律依据：《中华人民共和国社会保险法全文》第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。《中华人民共和国社会保险法全文》第二十九条 参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。