法律分析：
公司犯罪行为是否会影响员工的责任，要看具体情况而定。如果员工没有参与或知情，那么公司犯罪行为不会影响员工的责任，但公司需要为其行为承担法律责任。如果员工参与或知情，那么员工需要为自己的行为承担相应的法律责任。
法律依据：
《中华人民共和国刑法》第二十五条：犯罪单位的刑事责任，由单位承担；没有承担责任的，对直接责任人员和其他责任人员依照法律规定追究刑事责任。
《中华人民共和国劳动法》第八十条：用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令改正，给予警告，并可以责令支付劳动者的工资报酬等经济补偿：（一）未按照规定为劳动者缴纳社会保险费的；（二）未向劳动者支付劳动报酬或者拖欠劳动报酬的。
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百一十三条：在合同关系中，当事人可以在合同中约定争议解决方式；也可以在争议发生时协商解决。
以上法律依据表明，公司需要为自己的行为承担法律责任，员工需要为自己的行为承担相应的法律责任，而在合同关系中，当事人可以在合同中约定争议解决方式。