法律分析：在进行公司犯罪调查时，关键是保证调查结果的客观性，避免主观臆断和人为干扰。首先需要制定科学合理的调查程序，明确调查的目的、范围和方法，确保调查的全面性和准确性。其次，要注意保护涉案人员的权益，遵守相关法律规定和程序，防止误伤和诬告。最后，需要确保独立性和公正性，避免利益冲突和压力干预，采取必要的措施保护调查人员的独立性和公正性。
法律依据：
1. 《中华人民共和国企业犯罪责任法》第五条：对企业犯罪行为实行有罪推定，但能证明确有无罪的除外。
2. 《中华人民共和国刑事诉讼法》第二十二条：刑事诉讼中，应当依法收集、固定、审查证据。
3. 《中华人民共和国律师法》第二十五条：律师办理案件，应当遵守法律、法规和律师职业道德，坚持事实、证据和法律的原则。
4. 《中华人民共和国监察法》第十五条：监察机关承办监察事项，应当依法、客观、公正、独立行使监察权。