漱口水中的酒精成分乙醇，会让致癌物更易进入口腔组织中；如果一天使用3次以上漱口水，罹患口腔癌和咽喉癌的机率恐会上升。而虽然漱口水与口腔癌的关系尚不明确，由于其所含成分有药物，若是长期使用，有致癌疑虑是合理的，但是目前尚未有明确的证据。
漱口水不能杀菌
漱口水不能杀菌，只是抑菌，口腔中的细菌多，则会继续存在；而且牙菌斑必须靠机械性的刷牙和使用牙线，才能够去除，至于漱口水只能做为辅助性产品，通常都是牙周病手术后的患者使用。
口腔健康首重刷牙
其实，口腔健康首重刷牙，每天餐后和睡前洁牙，是预防牙周病和蛀牙的最重要工作；以及使用牙线或牙间刷洁牙，才是维护口腔健康最好的方法。