1、胃肠溃疡者少喝柠檬泡水：柠檬水味道酸，在柠檬果肉中含有较多的酸性物质，酸性物质会刺激胃酸分泌，适量饮用柠檬水可以促进食物消化，改善消化不良症状，但是胃肠溃疡者本就胃酸分泌过多，如果再大量喝柠檬水更会加剧对溃疡面的刺激，从而会导致病情加重。
2、不宜空腹饮用柠檬水：柠檬水中含有大量的有机酸成分，在空腹状态下，胃内没有食物的干预，饮用柠檬水后，柠檬水中的酸性成分会刺激到胃肠壁，从而容易引起肠胃不适等症。
3、冲泡柠檬温度不宜过高：冲泡柠檬一般用温水，因为过高的温度会释放出柠檬皮中的苦味物质，而且用热水泡柠檬，柠檬中的维生素C成分也会遭到破坏；另外，若是温度过低的话，柠檬中的芳香成分不易泡出，维生素C也很难析出，所以冲泡柠檬水时要注意冲泡温度，一般建议用60-70度的温水冲泡即可。
4、冲泡浓度不宜过高：在柠檬中含有大量的果酸，冲泡柠檬水的时候，浓度过高会刺激肠胃，引起肠胃不适，因此，一般在冲泡柠檬水时，1-2片柠檬就可以冲一大杯水。
5、一次性饮用量不宜过多：每天喝柠檬水的话，喝2-3杯即可，不宜超过1000毫升，适量喝柠檬水可以起到美容养颜、促进消化、减肥瘦身等作用，但是如果饮用过多，其酸性成分反而会刺激到胃肠壁，引起肠胃不适症状。
6、龋齿者不宜喝柠檬泡水：柠檬水中有机酸丰富，有机酸除了促进胃液分泌外，还具有刺激牙釉质的作用，经常喝柠檬水对于牙釉质有损伤作用，还会引起或者加重龋齿的情况。
7、糖尿病者不宜喝柠檬泡水：柠檬虽然味道是酸的，但是柠檬果肉中糖分含量也不低，因此糖尿病者不宜吃柠檬或者喝柠檬水。
8、睡前慎喝柠檬泡水：柠檬水中含有一定量的糖分，睡前喝容易导致人体血糖升高，睡前代谢缓慢，这些糖分还可能会转化为脂肪储存在人体中，所以一般是不建议睡前喝柠檬水的。
9、饮用后不宜晒太阳：柠檬是一种感光水果，在柠檬皮中，含有柠檬烯、香豆素类等感光物质，食用柠檬后容易使皮肤变得敏感，喝了柠檬水之后出去晒太阳，少部分皮肤敏感的人可能会出现皮肤发红、易晒黑等情况，所以喝柠檬水后最好少晒太阳。