【UK Biobank干货】如何优雅的从RAP平台下载原始影像数据
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发布时间：2024-12-29 09:49
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时间：2024-12-30 15:13
英国生物银行（UK Biobank）已发布了超过60000人的影像数据。本文介绍从Research Analysis Platform（RAP）系统直接下载原始影像数据的方法，适用于具备UKB Tier 3数据权限的用户。使用前提包括UK Biobank账号申请成功、Proposal申请成功、拥有AMS账号、数据使用费支付成功以及数据使用协议签署成功。
注意：UKB影像数据下载需要Tier 3数据权限，且每个项目生成的eid为随机生成，不同项目间无法通过eid匹配数据。大宗影像数据下载需要使用MD5和ukbfetch等工具，具体操作可见网上教程。
在RAP系统中，用户需登录并进入目标Project，找到Bulk文件夹，按照Brain MRI、Heart MRI、Whole Body DXA等类别查找数据。以提取Brain MRI影像数据为例，用户需进入dMRI子文件夹，文件命名格式为7位数字_5位数字_1位数字_1位数字，其中7位数字代表个体的eid，5位数字是Data Field ID。
用户随意选择一个zip压缩包进行下载，如2115417_20218_2_0.zip，即为eid为2115417的参与者的大脑MRI影像数据。下载后，解压文件，内部包含600多个dcm文件，可使用影像软件打开查看图像和动画。
下载和操作方法适用于其他各个部位的影像数据，关键在于zip文件名称中的7位数字标识的eid。更多关于UKB的攻略和干货，请持续关注「遗传社科研究」后续推送。
